1、被告主体不适格的处理是：驳回原告的诉讼请求。被告主体不适格法院仍会受理起诉，因为被体适格并不是起诉需符合条件，所以法院仍会受理进行审理，但会驳回原告的诉讼请求。
2、法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》
第一百二十二条 起诉必须符合下列条件：
(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织;
(二)有明确的被告;
(三)有具体的诉讼请求和事实、理由;
(四)属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
二、原告承担责任的范围
民事责任的基本原则是补偿受害人的损失，恢复其被损害的权利，对于被告不适格而承担民事责任的范围，也应以补偿不适格被告人因错误被诉所受损失为限，给予赔偿。通常应包括以下几类：
(一)差旅费、误工费、通讯费等损失。
此类损失是被告为进行诉讼活动必须支出的，是最基本的费用。被告包括其委托代理等费用支出，以及因误工所造成的工资收入的减少。
(二)律师费。
律师费是被告人委托律师代为诉讼而支出的费用。
(三)精神损失、商誉损失。
精神损失应予赔偿，现今已经成为人们的共识，此制度也应当适用于被告不适格案件。
希望以上内容能对你有所帮助，如果你还有其他问题可以点击下方按钮咨询，或者到华律网咨询专业律师。